Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clip1Q922J3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms