Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW8

Cd209d, CD209 antigen-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd209dQ91ZW8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cd209dQ91ZW8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd209dQ91ZW8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd209dQ91ZW8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cd209dQ91ZW8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd209dQ91ZW8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd209dQ91ZW8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cd209dQ91ZW8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd209dQ91ZW8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cd209dQ91ZW8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd209dQ91ZW8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd209dQ91ZW8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd209dQ91ZW8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cd209dQ91ZW8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cd209dQ91ZW8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd209dQ91ZW8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cd209dQ91ZW8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cd209dQ91ZW8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd209dQ91ZW8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd209dQ91ZW8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd209dQ91ZW8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd209dQ91ZW8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd209dQ91ZW8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd209dQ91ZW8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd209dQ91ZW8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd209dQ91ZW8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd209dQ91ZW8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd209dQ91ZW8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd209dQ91ZW8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cd209dQ91ZW8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Cd209dQ91ZW8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms