Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pde6cQ91ZQ1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms