Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cts3Q91ZD5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms