Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atl3Q91YH5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl3Q91YH5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms