Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx11Q91WL6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms