Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Csde1Q91W50 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms