Protein–RNA interactions for Protein: Q91W29

Cox4i2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i2Q91W29 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox4i2Q91W29 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i2Q91W29 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i2Q91W29 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i2Q91W29 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i2Q91W29 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i2Q91W29 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i2Q91W29 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i2Q91W29 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i2Q91W29 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i2Q91W29 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i2Q91W29 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i2Q91W29 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i2Q91W29 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i2Q91W29 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i2Q91W29 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms