Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NifkQ91VE6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms