Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc71Q8VEG0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms