Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpcsQ8VDG5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms