Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rapgef3Q8VCC8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
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