Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms