Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnaaf4Q8R368 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms