Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2K8

Uncharacterized protein C1orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R2K8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R2K8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8R2K8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8R2K8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R2K8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8R2K8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8R2K8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R2K8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R2K8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R2K8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R2K8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R2K8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R2K8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R2K8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R2K8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R2K8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R2K8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R2K8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R2K8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R2K8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R2K8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R2K8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R2K8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R2K8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R2K8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R2K8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R2K8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R2K8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R2K8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms