Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CipcQ8R0W1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CipcQ8R0W1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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