Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A0

Gtf2f2, General transcription factor IIF subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f2Q8R0A0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f2Q8R0A0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms