Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc5Q8K4Z2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms