Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hecw1Q8K4P8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hecw1Q8K4P8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms