Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defb12Q8K4N3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms