Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc3Q8K3W3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc3Q8K3W3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casc3Q8K3W3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc3Q8K3W3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc3Q8K3W3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc3Q8K3W3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc3Q8K3W3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc3Q8K3W3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc3Q8K3W3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc3Q8K3W3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc3Q8K3W3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc3Q8K3W3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casc3Q8K3W3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms