Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms