Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms