Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Txndc11Q8K2W3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Txndc11Q8K2W3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms