Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms