Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf3c1Q8K284 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms