Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Abcf3Q8K268 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms