Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1eQ8K202 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms