Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Sde2Q8K1J5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sde2Q8K1J5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms