Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh3Q8K1E6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms