Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem17Q8K0U3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem17Q8K0U3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms