Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip10Q8CJ53 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms