Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SbsnQ8CIT9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbsnQ8CIT9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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