Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE0

Serpina11, Serpin A11, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina11Q8CIE0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Serpina11Q8CIE0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms