Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NgefQ8CHT1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms