Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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