Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hpf1Q8CFE2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpf1Q8CFE2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms