Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms