Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph6aQ8CDR2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph6aQ8CDR2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph6aQ8CDR2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph6aQ8CDR2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph6aQ8CDR2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph6aQ8CDR2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph6aQ8CDR2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph6aQ8CDR2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph6aQ8CDR2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph6aQ8CDR2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph6aQ8CDR2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph6aQ8CDR2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph6aQ8CDR2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rsph6aQ8CDR2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms