Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Nsun3Q8CCT7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsun3Q8CCT7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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