Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn5Q8CBA2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms