Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc159Q8C963 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms