Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bhlhe22Q8C6A8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms