Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim35Q8C006 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim35Q8C006 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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