Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp47Q8BY87 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms