Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall4Q8BX22 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms