Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp38Q8BW70 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp38Q8BW70 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms