Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik4Q8BMF5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grik4Q8BMF5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms