Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c2Q8BL74 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms