Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp54Q8BL06 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms